В соответствии с пунктом 14.1 Положения об Экономическом Суде Содружества Независимых Государств (в редакции Протокола от 13 сентября 2017 года о внесении изменений в Соглашение о статусе Экономического Суда Содружества Независимых Государств от 6 июля 1992 года) деятельность Экономического Суда обеспечивается аппаратом Экономического Суда на постоянной основе.
Аппарат Экономического Суда выполняет следующие функции:
- подготовка материалов дела к рассмотрению и направление их судьям палаты;
- осуществление в пределах своих полномочий взаимодействия с судьями, государствами — участниками, институтами Содружества Независимых Государств, участниками процесса и другими лицами;
- осуществление функций секретаря судебного заседания;
- подготовка заседаний Экономического Суда и Пленума Экономического Суда;
- подготовка аналитических материалов о деятельности Экономического Суда, в том числе касающихся его практики и методов работы;
- материально-техническое обеспечение Экономического Суда;
- решение в пределах своих полномочий иных вопросов, касающихся обеспечения деятельности Экономического Суда.
Решением Совета глав государств Содружества Независимых Государств от 13 сентября 2017 года о некоторых вопросах деятельности Экономического Суда Содружества Независимых Государств определена численность аппарата Экономического Суда СНГ в количестве трех человек.